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2011年南京市全社會研究與開發（R&D）經費支出占地區生產總值（GDP）的比重達3.1%左右，遠高于全省和全國平均水平，也已經超過全省2020年率先基本實現現代化的2.8%的定量指標。
從“十一五”至今，科教人才資源豐富的南京R&D經費支出占GDP比重就一直高于全省和全國平均水平。根據今年初發布的《江蘇基本實現現代化指標體系》，全省到2020年率先基本實現現代化R&D經費支出占GDP比重的定量指標為2.8%，全國到2020年的目標是2.5%，而南京市在2006年這一指標就超過2.5%，2009年就已達到了2.85%。目前，全市擁有獨立科學研究與技術開發機構106家，R&D活動相對密集的行業包括：農、林、牧、漁業，采礦業，制造業，電力、燃氣及水的生產和供應業，建筑業，交通運輸、倉儲和郵政業，信息傳輸、計算機服務和軟件業，金融業，租賃和商務服務業，科學研究、技術服務和地質勘查業，水利、環境和公共設施管理業，教育，衛生、社會保障和社會福利業，文化、體育和娛樂業等。
R&D活動指在科學技術領域，為增加知識總量以及運用這些知識去創造新的應用而進行的系統的創造性活動，包括基礎研究、應用研究、試驗發展三類活動。R&D經費支出占GDP比重，可以衡量一個國家或地區科技活動規模及科技投入強度，反映其經濟增長的潛力和可持續發展能力，反映全社會科技投入和創新情況，是綜合實力和競爭力的核心標志，具有較強的國際、國內可比性。
來源：南京市科技局
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